Resumen El chancro del tallo y la sarna negra de la papa son enfermedades ocasionadas por el hongo Rhizoctonia solani grupo de anastomosis tres (GA-3PT), el cual afecta raíces, tallos y tubérculos de papa y reduce el rendimiento de los cultivos. El objetivo de la presente investigación fue determinar la diversidad genética de R. solani GA-3PT presente en los departamentos colombianos de Antioquia, Boyacá y Cundinamarca. La restricción enzimática de la región ribosomal (RFLP, por sus siglas en inglés) ITS-5.8S permitió la diferenciación e identificación específica de los grupos de anastomosis GA-3PT y GA2-1 y confirmó que el GA-3PT es el principal agente causal y origen etiológico de la enfermedad en Colombia. Mediante amplificación aleatoria de marcadores microsatélites (RAMs), por sus siglas en inglés), se observaron dos agrupamientos dentro de R. solani GA-3PT; el GA-3PT (A) comparte un índice de similitud del 78 % entre sí, en comparación con el GA-3PT (B) que presenta una similitud del 79 % entre sus aislamientos. Los agrupamientos no están relacionados con su origen geográfico, sino con el grupo de anastomosis al que pertenecen. La diversidad genética de Nei [D] de 0,25 confirma una alta diversidad genética para el GA-3PT mediante análisis RAMs, relacionada con un alto potencial evolutivo al interior del grupo GA3PT en Colombia. Finalmente, el hongo R. solani GA-3PT que se obtuvo en Cundinamarca tiene potencial adaptativo para emerger como patógeno de la papa criolla (Solanum phureja) en Colombia, posiblemente, debido a la semejanza de los patosistemas.

Abstract Stem canker and black scurf are potato diseases caused by the fungus Rhizoctonia solani, anastomosis group 3 (AG-3PT). This fungus affects potato roots, stems, and tubers, reducing crop yields. This study aims to determine the genetic diversity of R. solani AG-3PT obtained from the Colombian departments of Antioquia, Boyacá, and Cundinamarca. Restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis of the ITS-5.8S ribosomal DNA region allowed the differentiation and specific identification of AG-3PT and AG2-1 anastomosis groups. These results confirm that AG-3PT is the primary causative agent and etiological origin of stem canker and black scurf in Colombia. Two distinct subgroups within R. solani AG-3PT were identified using random amplified microsatellite markers (RAMs); AG-3PT (A) shares a similarity index of 78 %, and AG-3PT (B) shares a similarity of 79 % among its isolates. These subgroups were not linked to a geographical origin but to the AG group to which they belong. Nei’s genetic diversity [D] of 0.25 confirmed the high genetic diversity for AG-3PT through RAMs analysis, related to a high evolutive potential within the AG-3PT group in Colombia. Finally, the R. solani AG-3PT fungus obtained from Cundinamarca had the adaptative potential to emerge as a pathogen of Solanum phureja in Colombia, possibly due to the similarity between pathosystems.

RESUMO As culturas de soja produzidas nas planícies do leste da Colômbia vem sendo afetadas pela incidência de ferrugem. A doença, ainda considerada oficialmente, pelo Departamento de Agricultura da Colômbia (ICA) como ferrugem americana (ocasionada pelo fungo Phakopsora meibomiae), causa sérios danos à produção nas áreas de cultivo da soja. Os sintomas têm sido observados desde 2004 na metade superior das plantas durante os estágios vegetativos, como lesões marrom-avermelhadas. Em 2005 e 2018, tecidos foliares infectados e uredinosporos foram coletados em uma área experimental e cultivos comerciais dessa cultura. Uma vez que a identificação morfológica e os postulados de Koch confirmaram a presença de Phakopsora spp., foi realizada uma caracterização molecular para se identificar, a nível de espécie, o patógeno associado à ferrugem da soja. Estes foram baseados em procedimentos padrão com espaçadores de transcrição internos (ITS) do rDNA e amplificação por PCR com primers específicos para P. meibomiae e P. pachyrhizi. As sequências obtidas foram verificados por meio do Blast no site do GenBank/NCBI. Os resultados indicaram que Phakopsora pachyrhizi Sydow é, de fato, o agente causal da ferrugem da soja na Colômbia, considerando-se as amostras coletadas em 2005 e 2018. As sequências do ITS-rDNA de P. pachyrhizi foram depositadas com os números de acesso do GenBank MK933723 até MK933731. A informação foi repassada ao ICA, para que atualize oficialmente a situação fitossanitária desse patógeno da soja na Colombia.

ABSTRACT Soybean crops grown in the plains of eastern Colombia have been affected by the incidence of rust. This disease, still officially regarded as American soybean rust (caused by Phakopsora meibomiae) by the Colombian Department of Agriculture (ICA), causes serious damage to soybean growing areas. Symptoms of rust, such as reddish-brown lesions, have been observed since 2004 in the upper half of plants during vegetative stages. In 2005 and 2018, infected leaf tissues and uredinospores were collected from an experimental area and from commercial soybean fields. Once morphological identification and Koch’s postulates confirmed the presence of Phakopsora spp., molecular characterization was performed to identify the pathogen associated with the disease to species level. This was based on standard procedures using internal transcribed spacer (ITS) regions of rDNA and PCR amplification with specific primers for Phakopsora meibomiae and P. pachyrhizi. The obtained sequences were BLASTed against GenBank/NCBI data bank. Results indicated that P. pachyrhizi Sydow is in fact the causative agent of soybean rust in Colombia, considering the samples collected in 2005 and 2018. The ITS-rDNA sequences of P. pachyrhizi were deposited at GenBank under the accession numbers MK933723 to MK933731. This finding was reported to ICA, so that they could officially update the phytosanitary status of this soybean pathogen in Colombia.

RESUMO A queima da folha e morte de pastagens do gênero Urochloa são causadas pelo fungo Rhizoctonia solani. Objetivou-se determinar que patógenos do complexo de espécies do gênero Rhizoctonia estão associados à queima da folha e bainha em Urochloa e arroz, nos Llanos Colombianos. Utilizando-se o sistema de transcetos lineares, foram amostradas áreas de pastagens de Urochloa simpátricas, adjacentes às de arroz. A identificação dos patógenos foi efetuada por caracterização morfológica, detecção molecular baseada em iniciadores específicos e sequenciamento da região ITS-5,8S do rDNA. R. solani AG-1 IA predominou como patógeno associado à queima da folha em todas as amostras de U. brizantha cv. 'Toledo' e híbrido Urochloa cv. 'Mulato'. Além de R. solani AG-1 IA (18 % das amostras), R. oryzae-sativae (71 %) e Sclerotium hydrophilum (11 %) também foram detectados. No teste de patogenicidade, o fungo R. solani AG-1 IA foi o mais agressivo a Urochloa, enquanto R. oryzae-sativae ocasionou sintomas muito leves de infecção. Este é o primeiro relato de que os fungos R. oryzae-sativae e S. hydrophilum estão associados ao complexo de doenças da bainha do arroz, na Colômbia.

ABSTRACT Foliar blight and death of signalgrass (Urochloa spp.) pastures are caused by the Rhizoctonia solani fungus. This study aimed at determining which pathogens from the Rhizoctonia species complex are associated with leaf and sheath blight in Urochloa and rice, in the Colombian Llanos. Sympatric areas of Urochloa pastures adjacent to rice cropping areas were sampled using a linear transect system. The pathogens were identified using morphological traits, molecular detection based on specific primers and sequencing of the ITS-5.8S rDNA region. R. solani AG-1 IA predominated as the pathogen associated with foliar blight in all samples from U. brizantha cv. 'Toledo' and hybrid Urochloa cv. 'Mulato'. Besides R. solani AG-1 IA (18 % of the samples), Rhizoctonia oryzae-sativae (71 %) and Sclerotium hydrophilum (11 %) were also detected. In the cross-pathogenicity test, the R. solani AG-1 IA fungus was the most aggressive to Urochloa, while R. oryzae-sativae produced very mild infection symptoms. This is the first report of R. oryzae-sativae and S. hydrophilum associated with the complex of rice sheath blight diseases in Colombia.